Трудно фотографировать все, что движется — об этом вам скажет любой, кто когда-нибудь пытался сделать фотографию непоседливого ребенка. Команда исследователей решила эту проблему (правда, пока в микроскопическом масштабе) с помощью программы, которая позволяет микроскопам автоматически отслеживать объекты, невидимые для человеческого глаза.
Обычно запись явлений, наподобие роста корня растения, на практике означает дни, проведенные за регулярной подстройкой микроскопа. С помощью нового ПО эта проблема исчезла и исследователи в течение трех дней наблюдали за ростом и делением клеток растения Arabidopsis thaliana, о чем они сообщают на портале bioRxiv. Для этого потребовалось специальное оборудование: микроскоп, в котором используются лазеры и флуоресцентные лампы, чтобы скомпоновать 3D-изображения; специальная система освещения, чтобы поддерживать растения здоровыми в течение более длительного времени, чем обычно; а также стойка для микроскопа для горизонтального ориентирования, чтобы растения могли расти вертикально и помещаться в кадр.
Команда даже разместила растения на вращающейся тарелке, чтобы изучить, как гравитация меняет корневой рост, что поможет ученым разработать лучшие способы выращивания растений в космосе. Чтобы продемонстрировать эффективность программы за пределами одного исследования, ученые также испытали ее с другим микроскопом, наблюдая за группами клеток, которые перемещаются в растущих эмбрионах рыбки данио (Danio rerio). Программа распространяется абсолютно бесплатно, а потому каждая научная группа может воспользоваться ею и предложить свои правки, которые сделают ПО более эффективным.
Василий Макаров
